网站结构是指网站文件夹及文件所存储的真是位置所表现出来的结构。一个结构良好的网站对SEO非常重要，对搜索引擎的友好性及用户体验度有着非常高重要的影响。网站结构主要有扁平网站结构和树形网站结构两种。
1. 扁平网站结构
扁平网站结构是指网站的所有页面都保存在网站根目录。这种结构的网站网络蜘蛛的爬取效率高，只需要一次访问就能遍历网站中的所有页面，有利于网站的检索和排名。
通常情况下，扁平网站结构更适用于较为简单的小型网站，由于大型网站的网页数量较多，若大量的网页文件都保存在网站根目录下，就会增加整个网站组织、查找和维护工作的难度。
2.树形网站结构
树形网站结构是指将网站中的网页文件按照类别及从属关系保存到不同文件夹和子文件夹中。树形网站结构类别层次清晰，识别度高，可以很方便地进行管理和维护，搜索引擎在处理其内部链接时，也可以更加容易地传递权重，该网站结构适合内容类别多、内容量大的综合性网站。
一个树形结构网站的文件夹中通常会有多个不同层级，如图所示。
综上所述，网站结构优化的核心就是确保结构的清晰化，方便站长在后期进行更加深入的维护和优化。